Die beiden roten Blumen sind das hervorgehobene Merkmal des Charakters Gröbenzells als Gartenstadt.

Der Bach in der Mitte des Wappens soll den Verlauf des durch das Gemeindegebiet fließenden Gröbenbachs symbolisieren.

Die weiß-blauen Balken stellen die Zollschranke dar, die an die Zollstele am Gröbenhüterhaus erinnert.